Keberadaan sistem rujukan dalam sistem pelayanan kesehatan nasional, berakibat pada meningkatnya jumlah kasus sulit yang masuk ke RS rujukan nasional maupun RS pendidikan karena tak tertangani baik karena keterbatasan fasilitas, pengetahuan maupun tenaga ahli di fasyankes primer.  Infeksi parasit dan jamur termasuk yang sering luput dari diagnosis sehingga memicu kebutuhan akan Spesialis Parasitologi Klinik untuk penegakkan diagnosis maupun tatalaksananya.

​

Saat ini Departemen Parasitologi FKUI telah membuka Program Studi Pendidikan Dokter Spesialis Parasitologi Klinik yang pertama di Indonesia, yang bertujuan untuk menghasilkan dokter yang ahli di bidang parasitik dan jamur. Peserta didik memiliki kesempatan untuk dapat belajar dari para pakar parasitologi dan mikologi, mempelajari kasus penyakit parasitik dan jamur, ikut berpartisipasi dalam kegiatan riset dan berperan serta dalam kegiatan pengabdian kepada masyarakat.

​

Pendidikan dokter spesialis Parasitologi Klinik FKUI dalam pembelajarannya memakai konsep belajar aktif dan interaktif. Residen akan belajar menghadapi berbagai kasus, baik pasien rawat inap, maupun rawat jalan yang dirujuk ke poli parasitologi dan kerja praktek di RS pendidikan utama/jejaring sehingga memiliki keterampilan dalam diagnosis, interpretasi hasil pemeriksaan laboratorium parasit dan jamur, termasuk dalam pemilihan, penilaian dan evaluasi jenis tes untuk diagnosis infeksi parasit dan jamur serta turut serta dalam pengelolaan pasien dengan dugaan infeksi parasit dan jamur.

​

Lulusan parasitologi klinik memiliki kesempatan untuk bekerja di RS rujukan nasional A dan B serta RS Pendidikan di seluruh Indonesia, Balai Laboratorium/Laboratorium mandiri sebagai dokter penanggung jawab laboratorium Parasitologi, melayani konsultasi pasien dari sejawat lain, konsultan parasitologi bagi kemenkes, dan sebagai staf pengajar Parasitologi. Saat ini lulusan spesialis Parasitologi Klinik FKUI telah berjumlah 25 orang yang tersebar di berbagai daerah dan bekerja sebagai dosen, dokter RS dan kepala laboratorium.

 

Prodi Parasitologi Klinik FKUI telah terakreditasi A LAMPTKES. Registrasi dapat dilakukan segera dengan persyaratan minimal adalah dokter. Dokter lulusan S2 Biomedik Parasitologi juga berkesempatan untuk melakukan transfer kredit sehingga dapat mempersingkat masa studi calon peserta didik.